Фамилия Софьин отвечает на вопрос «чей?» и образована от женского имени Софья — русского варианта греческого София, что значит «премудрая». Такую фамилию получал ребёнок, внук или более дальний потомок женщины по имени Софья, чаще всего — сын или человек, находившийся под её опекой. Модель с суффиксом -ин в русских фамилиях традиционно указывает на принадлежность к матери: если глава семьи был известен по отцу, использовали -ов/-ев, а форма на -ин закреплялась за теми, кого называли по материнскому имени. Поэтому Софьин — это «сын Софьи», «Софьин человек».

Стоит различать фамилии Софьин и Софин. Вторая форма чаще восходит к церковнославянскому написанию имени София и встречается в среде духовенства, где фамилии нередко давали по имени святой или по храму в честь Святой Софии. Софьин же выглядит более «бытовым», крестьянским или мещанским вариантом: он естественно возникал в живой речи, где имя произносили как Софья. В документах XVIII–XIX веков написание могло колебаться: в метрических книгах одну и ту же семью порой записывали то как Софьины, то как Софины, пока окончательно не закреплялся один вариант.

Само имя София пришло на Русь вместе с христианством и долго оставалось редким, а массовое распространение получило лишь в XVIII–XIX веках, когда дворянство и городские сословия стали называть дочерей в честь византийских святых. Это значит, что фамилия Софьин не может быть древней: её носители — потомки людей, живших не ранее петровского времени, когда имя стало входить в обиход. В крестьянской среде, где фамилии массово закреплялись после отмены крепостного права в 1861 году, Софьины появлялись именно тогда, и часто это были семьи, где мать или бабушка звалась Софьей и пользовалась особым уважением.

Встречается и другая, менее вероятная версия: связь с мужским именем Софон или Софоний, которое в просторечии иногда сокращали до Софья. Но эта гипотеза слабая, поскольку от мужских имён на -ий фамилии обычно образовывали через -ев (Софонтьев, Софронов), а форма Софьин чётко указывает на женскую основу. Кроме того, в старых переписных книгах встречаются записи вида «Софьин сын», где прямо названа мать, так что основная версия остаётся предпочтительной.

Сегодня фамилия Софьин распространена в центральной России и Поволжье, но нигде не образует плотных гнёзд. Носителей немного, и это скорее редкая, чем массовая фамилия, что типично для имён, вошедших в обиход поздно. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать их в метрических книгах второй половины XIX века — именно там, скорее всего, и зафиксирован момент, когда сына Софьи впервые записали Софьиным.