Фамилия Сонне — редкий случай, когда форма не даёт однозначного ответа о происхождении. В русском языке она выглядит как иноязычное заимствование: окончание -е нехарактерно для исконно русских фамилий, которые обычно заканчиваются на -ов, -ин или -ский. Скорее всего, перед нами фамилия немецкого или скандинавского происхождения, записанная в русской транслитерации без изменений.

В немецком языке Sonne означает «солнце». Фамилия могла возникнуть как прозвище человека с солнечным, светлым характером, либо как топонимическое — от названия дома или местности. В германской традиции было принято давать фамилии по названию жилища, например, «Haus zur Sonne» — «Дом у Солнца». Житель такого дома мог получить фамилию Sonne. В скандинавских странах (датский, норвежский) Sonne — тоже существующая фамилия, и значение там то же самое.

Второй, менее очевидный вариант — фамилия могла образоваться от краткой формы имени Соломон (в некоторых европейских языках — Sönne, Sonne). Но это скорее исключение, чем правило.

Если носитель фамилии Сонне — русский, то, вероятнее всего, его предки были немцами-колонистами, переселившимися в Российскую империю в XVIII–XIX веках, или обрусевшими выходцами из Прибалтики. В России фамилия редкая, встречается точечно, без выраженного регионального центра. Встречаются также варианты написания с одной «н» — Соне, но форма Сонне (с двойной) более устойчива и ближе к оригиналу.

Словообразовательно фамилия не имеет русского суффикса, поэтому её «не склоняют» в быту: «познакомился с Сонне», «книга Сонне». Это дополнительный признак того, что фамилия не прошла адаптацию через модель отчества, а вошла в русский обиход в готовом виде.