Фамилия Спасенкова образована от мужской формы Спасенков, а та — от прозвища или имени Спасенок. Основа здесь — «Спас», то есть Спаситель, Иисус Христос. Такие прозвища на Руси давали не напрямую, а через именование «Спас»: так могли называть человека, родившегося в день церковного праздника Спаса (Медового, Яблочного или Орехового), либо того, кто служил при храме, посвящённом Спасу (например, Спасская церковь). В редких случаях Спасом могли прозвать человека, спасшегося от смерти или спасшего кого-то, но это менее вероятно.

Суффикс «-енок» (в форме Спасенок) типичен для северных и центральных русских говоров, особенно для Вологодской, Архангельской и Костромской областей. Он обозначал «сына» или «молодого человека»: Спасенок — буквально «сын Спаса». Потом к этой основе добавился патронимический суффикс «-ов», и фамилия приобрела вид Спасенков, а женский вариант — Спасенкова. Такая модель (прозвище на «-енок» + «-ов») встречается реже, чем простой суффикс «-ов» от полного имени, что делает фамилию диалектно окрашенной.

В ономастике есть и версия, что Спасенков могло быть искусственной семинарской фамилией — такие давали ученикам духовных училищ в честь праздника или иконы. Однако суффикс «-енок» для семинарских фамилий нехарактерен (там чаще «-ский»: Спасский), так что версия с мирским прозвищем надёжнее.

Географически фамилия Спасенкова встречается в основном в русских регионах — Вологодской, Кировской, Ивановской областях, а также в Сибири, куда переселенцы уходили с севера. Носителей немного, фамилия редкая, что подтверждает её локальное происхождение. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и церковнослужителями низшего ранга — пономарями или дьячками при Спасских церквях.

Однокоренные фамилии — Спасский, Спасов, Спасибенко — имеют другую географию и модели образования. Спасенкова стоит особняком именно из-за «-енок», который сразу указывает на северорусский говор и на то, что фамилия сложилась не в книжной среде, а в живой речи.