Фамилия Стефоновский — одна из тех, что сразу выдают церковное происхождение. В её основе лежит каноническое имя Стефан (от греческого «стефанос» — венок, корона), которое в русской традиции часто принимало форму Степан. Но здесь мы видим не просто отчество, а более сложную модель образования: к имени добавили суффикс -овск-, характерный для фамилий польской или западнорусской шляхты. В сочетании с окончанием -ий это даёт типичную семинарскую или дворянскую фамилию — Стефоновский.

Такая словообразовательная цепочка — ключ к социальному статусу предка. Фамилии на -ский/-цкий в XVII–XIX веках часто получали выпускники духовных семинарий. Им меняли простонародное отчество (вроде Степанов) на более благозвучное и «учёное» — Стефоновский, чтобы подчеркнуть принадлежность к образованному сословию. Поэтому с высокой вероятностью первый носитель этой фамилии был либо священником, либо выходцем из духовного звания, окончившим семинарию.

Впрочем, есть и другая версия, менее распространённая, но тоже состоятельная. Суффикс -овск- мог указывать на географическую привязку: фамилию могли дать по названию села или поместья, где жил владелец, например, Стефаново или Стефановка. Такие топонимические фамилии были особенно популярны на землях бывшей Речи Посполитой — в Беларуси, на Украине, в западных областях России. В этом случае Стефоновский — это не «сын Стефана», а «тот, кто из Стефанова».

Интересно, что фамилия сохранила старую, церковнославянскую форму имени — Стефан, а не более привычное Степан. Это лишний раз подтверждает её книжное, а не народное происхождение. В то время как фамилии Степанов, Степашин, Степаненко образованы от обиходного варианта, Стефоновский стоит особняком, указывая на сознательный выбор «высокого» стиля. Среди носителей этой фамилии почти не встречается крестьян — она оставалась уделом духовенства и, реже, мелкопоместного дворянства.