Фамилия Стефоняк отвечает на вопрос «чей будете?» и указывает на прямого потомка человека по имени Стефан. В основе лежит каноническое имя Стефан, которое пришло из древнегреческого языка и переводится как «венок». Это имя носил первомученик Стефан, который, согласно Деяниям апостолов, первым выступил в Синедрионе — законодательном собрании Иерусалима — со знаменитой обвинительной речью в адрес священников, осудивших Христа.

Изначально фамилия, скорее всего, звучала как Стефаняк. Суффикс -як в славянской традиции типичен для западноукраинских и белорусских земель: он образует имена по отцу, отвечая на вопрос «чей сын?», и часто встречается в фамилиях на -ук/-юк, -ак/-як. В таком виде фамилия означает «сын Стефана» или «маленький Стефан».

Позднее в написании произошла любопытная фонетическая замена: гласный «а» в корне изменился на «о», и фамилия приобрела современный вид Стефоняк. Это следствие влияния «окающих» говоров, характерных для северных русских территорий и части среднерусских диалектов, где безударный «а» произносился и, соответственно, фиксировался на письме как «о». Таким образом, потомок человека по имени Стефан со временем получил фамилию Стефоняк, сохранив в ней и имя предка, и диалектную особенность той местности, где семья жила после переселения с западнорусских земель.

Встречаются и родственные варианты этой фамилии — Стефанюк, Стефаненко, Стефановский, — но форма Стефоняк интересна именно тем, что в ней соединились два пласта истории: древнее греческое имя с библейским сюжетом и живая народная фонетика, изменившая его звучание на русской почве.