Фамилия Стоножко — один из тех редких случаев, когда прозвище перешло в наследственное имя почти без изменений, сохранив живую разговорную интонацию. В её основе лежит украинское или южнорусское слово «стонога» — так в некоторых говорах называли сороконожку или многоножку. Человек мог получить такое прозвище за суетливость, быстрые и мелкие шаги или за необычную походку — словно ног у него много, а не две.

Обратите внимание на суффикс -ко. В украинской и белорусской ономастике он традиционно выполнял две роли: указывал на «сына» или «потомка» (как уменьшительно-патронимическая форма) и одновременно закреплял прозвище в бытовой речи. То есть Стоножко — это буквально «сын того, кого прозвали Стонога», или просто «маленький Стонога». Такая модель типична для западных и центральных областей Украины, а также для юга России, где украинское влияние было сильным.

Географически фамилия Стоножко встречается редко. Наиболее вероятные места её возникновения — Полтавщина, Черниговщина или Харьковщина, где диалектное слово «стонога» было в ходу. В дореволюционных метриках и ревизских сказках она почти не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении — скорее всего, в XVIII–XIX веках, когда фамилии активно закреплялись за крестьянскими и казацкими родами.

Спорных версий происхождения здесь немного. Можно было бы предположить связь с глаголом «стонать» (стон + нога), но это искусственное построение: в таком случае форма была бы «Стоногов» или «Стоногин». Украинское же «стонога» как название насекомого — прямое и логичное объяснение, подкреплённое диалектными словарями. Фамилия не перешла в дворянские или купеческие роды, оставаясь в крестьянской и казацкой среде, что типично для прозвищ, образованных от бытовых наблюдений.