Фамилия Султакеев — редкий случай, когда тюркский корень сплавился с русским патронимическим суффиксом, но при этом сохранил узнаваемое арабское звучание. В основе лежит личное имя Султаке, которое представляет собой уменьшительно-ласкательную форму от имени Султан. В тюркской среде суффикс -ке придавал имени оттенок «маленький», «младший» или просто нежный: Султаке — буквально «Султанчик», «князёк».

Имя Султан в кочевых и мусульманских обществах было не столько титулом правителя, сколько престижным именем, которое давали в честь уважаемого предка или в надежде на властный характер. Соответственно, Султакеем называли не сына султана, а сына человека по прозвищу Султаке. Фамилия строится по классической русской модели: к основе на -а/-е прибавляется суффикс -ев (Султаке-ев), что значит «принадлежащий Султаке», «из его рода».

Географически фамилия тяготеет к Волго-Уральскому региону и Западной Сибири. Она встречается у татар, башкир, а также у казахов, но в последнем случае чаще в форме Султакеев (с сохранением окончания -ев, что выдает влияние русской административной записи). В дореволюционных метрических книгах Оренбургской и Уфимской губерний можно найти крестьян и отставных солдат с этой фамилией — то есть носители не принадлежали к аристократии, а были выходцами из податных сословий, принявшими фамилию по отцу.

Интересная деталь: в некоторых говорах фамилия могла писаться через «а» — Султакаев, что отражает диалектное произношение, где конечный гласный звук имени редуцировался. Однако нормой закрепился вариант с «е», как более близкий к книжному написанию.