Фамилия Султуханова — яркий пример того, как в русской фамилии сплавились тюркские корни и русская модель фамилии. На слух она звучит непривычно для исконно русского уха, но при ближайшем рассмотрении её происхождение оказывается прозрачным и логичным.

В основе фамилии лежит мужское личное имя Султухан. Это сложное имя, составленное из двух тюркских компонентов. Первый — «султ» (или «сулд»), что в древнетюркской и монгольской традиции означает «удача», «благодать», «счастливое предзнаменование» (в частности, знамя-фетиш, приносящее победу). Второй — «хан» (владыка, правитель). Таким образом, имя Султухан можно перевести как «хан удачи» или «счастливый правитель». Это имя было престижным и указывало на высокий статус или пожелание величия ребёнку.

Фамилия образована по классической русской модели: к основе имени Султухан добавился патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность: «чей сын?» — Султуханов. Женская форма Султуханова — это вариант этой же фамилии, закреплённый за женщиной. В русской традиции такие фамилии на -ов/-ев поначалу были прерогативой знати и служилого сословия, но со временем распространились и среди крестьян, в том числе среди тюркских народов, принявших православие или интегрированных в российскую имперскую систему.

Географически фамилия Султуханова встречается преимущественно в регионах с тюркским населением: на Северном Кавказе (особенно в Дагестане, Чечне, Ингушетии), в Татарстане, Башкортостане, а также среди казахов и ногайцев. В этих местах имя Султухан (и его варианты Султанхан, Солтухан) было распространённым, а фамилия, соответственно, не редкость. В русских центральных областях она почти не встречается.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму основы: имя Султухан — не стяжённое, полное, в отличие от более поздних вариантов вроде Султанов или Султанханов. Это может указывать на то, что фамилия закрепилась в письменных документах достаточно рано, до того, как имя «Султухан» вышло из активного употребления. Сейчас носители фамилии — это потомки тех, кого когда-то назвали «сыном счастливого хана».