Фамилия Сунгатова — женская форма фамилии Сунгатов, и её происхождение почти наверняка связано с тюркскими языками. Основа «сунгат» или «сунгат» встречается в башкирском, татарском и казахском именах и прозвищах. Наиболее вероятное толкование — от имени Сунгат, которое восходит к арабскому «сун‘ат» (صنعة), что означает «мастерство», «ремесло», «искусное дело». В таком случае предок Сунгатовых мог быть искусным мастером, ремесленником, или же имя дали в пожелательном смысле, чтобы ребёнок вырос умельцем.

Словообразовательная модель здесь простая: к основе на твёрдый согласный добавляется русский патронимический суффикс -ов, а затем женское окончание -а. Это типичный случай, когда тюркское личное имя или прозвище легло в основу русской по форме фамилии. Мужская форма Сунгатов фиксируется в ономастических справочниках как фамилия, распространённая среди башкир и татар, особенно в Башкортостане и Челябинской области, что косвенно подтверждает тюркские корни.

Встречается и менее распространённая версия, что Сунгатов может быть образован от топонима — например, от названия речки Сунгат или села Сунгатово. Однако такие географические названия в свою очередь обычно происходят от того же личного имени, так что это не противоречит основному объяснению, а лишь уточняет путь: сначала имя, потом деревня, потом фамилия по месту жительства. Но для носителей фамилии Сунгатова наиболее прямая и логичная связь — с именем предка-мастера.