Фамилия Супес — редкая и неочевидная. На первый взгляд она похожа на иноязычное заимствование или искусственное сокращение, но при ближайшем рассмотрении вскрывается её вероятная славянская природа, связанная с диалектной лексикой и прозвищами.

Скорее всего, в основе фамилии лежит не имя, а прозвище или географический термин. В русских говорах слово «супесь» (или «супесок») обозначает тип почвы — смесь песка и глины. Человек, получивший прозвище Супес, мог жить на такой земле, работать с ней или быть владельцем участка, который так называли. Фамилия образована по модели, характерной для украинской и южнорусской ономастики: прозвище без патронимического суффикса (-ов, -ин) перешло в фамилию напрямую, в «чистом» виде. Это указывает на то, что прозвище было достаточно ярким и запоминающимся, чтобы закрепиться без дополнительной обработки.

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — связь с глаголом «супить» (хмурить, морщить) или «супиться» (сердиться). В этом случае Супес — человек с суровым, нахмуренным выражением лица, «супый». Однако фонетически форма «Супес» плохо ложится на эту основу: обычно от «супить» образуются фамилии Супин, Супов, Супята. Версия с почвой выглядит органичнее, тем более что слово «супесь» общеупотребительно в геологии и сельском хозяйстве, а прозвища по признаку места жительства — одни из самых древних.

Фамилия почти не встречается в центральных областях России, её ареал — южные регионы (Белгородская, Воронежская, Ростовская области) и восток Украины. Встречаются также варианты написания Супесь и Супесс, но основная форма — без мягкого знака на конце, что типично для фамилий, образованных от существительных мужского рода.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Супесников, Супесский) показывает, что они тоже редки и, скорее всего, возникли в одной местности. Это говорит о том, что носители фамилии Супес — потомки одного рода, получившего прозвище по земле, на которой жили их предки.