Фамилия Супрыгин ведет начало от прозвища или имени, которое в старину звучало как Супрыга. Слово это не встречается в современных словарях, но его корень прослеживается в глаголе «супрягать» или «супрячь» — то есть соединить, связать, запрячь вместе. В русских говорах «супряга» означала совместную упряжку лошадей или волов, а также объединение нескольких хозяев для общей работы — например, чтобы вспахать поле, когда у одного крестьянина не хватало своей тягловой силы. Такая форма кооперации называлась «супряга», и человек, который участвовал в ней или организовывал её, мог получить прозвище Супрыга.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Супрыгин — это «сын Супрыги» или «из семьи Супрыги». Модель образования типична для русских фамилий, возникших в крестьянской среде в XVI–XVII веках. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от мужских имен на твердый согласный, -ин характерен для основ на -а/-я. Это косвенно подтверждает, что исходное прозвище было женского рода или же мужским с окончанием на -а, как многие древнерусские имена и прозвища (Молча, Нелюба, Супрыга).

Географически фамилия Супрыгин встречается в основном в центральных и южных областях России, особенно в бывших Курской, Орловской, Тамбовской губерниях. Там традиция супряги — совместной пахоты — была распространена вплоть до начала XX века. Есть также вариант написания Супрягин, но он редок; в документах XIX века оба написания могли сосуществовать у одной и той же семьи из-за нестабильности акающего произношения.

Таким образом, носитель фамилии Супрыгин, скорее всего, происходит из крестьян-земледельцев, чей предок либо был участником артельной работы, либо получил прозвище за умение организовать общее дело. Фамилия не дворянская, не искусственная — она выросла из живого быта русской деревни, где слово «супряга» было понятно каждому пахарю.