Фамилия Святодухова — редкий случай в русском ономастиконе. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, которые образованы от мирских имён, прозвищ или профессий, эта фамилия имеет прямое отношение к церковной лексике и, скорее всего, к названию храма или монастыря.

Основа фамилии — «Святой Дух», третье лицо Святой Троицы в христианстве. Суффикс -ов указывает на принадлежность, то есть буквально Святодухов — «относящийся к Святому Духу». Однако так могли назвать не человека, а священника, служившего в церкви Святого Духа, или монаха из обители с таким посвящением. В русской традиции фамилии духовенства часто образовывались от названий церковных праздников, икон или храмов. Например, Успенский, Рождественский, Троицкий — и Святодухов стоит в этом же ряду, хотя и с другим суффиксом.

Форма Святодухова — женская, от мужского варианта Святодухов. Мужская форма могла быть дана выпускнику семинарии или священнику, который получил «искусственную» фамилию при поступлении в духовное училище. Это было распространённой практикой в XIX веке: будущим служителям церкви давали фамилии по церковным понятиям, чтобы подчеркнуть их статус. Однако не исключён и более простой путь: фамилия могла возникнуть у крестьянина, который жил рядом с церковью Святого Духа и получил прозвище «Святодухов» — «тот, кто при той церкви».

Географически фамилия привязана к местам, где были храмы в честь Святого Духа. Такие церкви встречались по всей России, но особенно часто — на Русском Севере, в Поволжье и в центральных губерниях. Встречаются и однокоренные варианты: Святодуховский, Святодухов — последний без суффикса принадлежности, что тоже встречается у духовенства.

Важная деталь: фамилия не имеет никакого отношения к личным качествам предка. Она не говорит о том, что он был «святым духом» или обладал каким-то особым даром. Это чисто «церковная» или «топонимическая» фамилия, которая родилась из названия места или должности. Если ваши предки носили её, скорее всего, они были либо приходскими священниками, либо людьми, жившими при монастыре или селе с церковью Святого Духа.