Фамилия Свыстунова — женская форма фамилии Свыстунов, которая принадлежит к распространённому типу «говорящих» прозвищ, связанных с манерой речи или поведения. Её основа — древнерусское слово «свыстун», то есть «свистун». Так в старину называли человека, который любил свистеть, делал это громко и часто, или же того, кто свистом подавал сигналы — пастуха, сторожа. В переносном смысле «свистуном» могли назвать и пустого болтуна, ветреного человека. Слово «свыстун» зафиксировано в русских говорах, где «свыстать» означало «свистеть», и встречается в памятниках письменности.

Модель образования проста: к основе прозвища Свыстун добавили притяжательный суффикс -ов, что указывает на принадлежность к главе семьи («чей?» — Свыстунов сын). Суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ и мирских имён. Интересно, что в фамилии сохранилось древнее чередование «св-» вместо современного «сви-»: это архаичная черта, которая в некоторых говорах удерживалась дольше. Встречаются варианты написания — Свистунов, но форма с буквой «ы» встречается реже и может указывать на диалектное произношение или намеренное сохранение старинного звучания.

Географически фамилия Свыстунов тяготеет к южнорусским и центральным областям. По данным переписей, носители фамилии встречались в Курской, Орловской, Тамбовской губерниях. Это косвенно подтверждает, что прозвище бытовало в среде крестьян и однодворцев — сословий, где прозвища часто закреплялись за целыми родами. В дворянских родословных книгах фамилия не отмечена, что говорит о её простонародном происхождении.

В отличие от многих фамилий на -ов, у Свыстунова нет спорных версий: корень прозрачен, а альтернативные толкования (например, от тюркского «свыстун» — якобы «храбрец») не подкреплены источниками и выглядят натяжкой. Единственная лингвистическая тонкость — это написание через «ы», которое для современного уха звучит необычно, но именно оно и выдает старую, диалектную основу.