Фамилия Таухутдинова — женская форма мужской фамилии Таухутдинов, и её разговор лучше начать не с корня, а с суффикса и географии. Суффикс -ов указывает на русскую модель образования от отчества или прозвища: в данном случае от татарского или башкирского имени Таухутдин. Это типичный пример фамилии, которая по форме стала русской (через суффикс принадлежности), но по происхождению корня осталась в тюрко-мусульманской среде. Такие фамилии особенно часты у татар, башкир и других народов Поволжья и Приуралья.

Основа имени Таухутдин сложная. Первая часть «тау» восходит к тюркскому слову «тау» — гора. Вторая часть — «хутдин» — это искажённое арабское «худжжат ад-дин» или «хутбат ад-дин», что означает «довод веры» или «проповедь веры». Вместе имя Таухутдин можно перевести как «гора веры» или «твердыня веры» — метафора стойкости и крепости в религиозном смысле. В татарской и башкирской ономастике такие составные имена с корнем «дин» (вера) и тюркским определением — не редкость, например, Гайнутдин, Сафиуллин.

Встречаемость фамилии Таухутдинова невысока, и она почти не выходит за пределы Татарстана и Башкортостана. Встречаются варианты написания с одной «т» — Таухутдинова, но это скорее опечатка, чем диалектная форма. По социальному составу предки носителей фамилии, скорее всего, были крестьянами или сельскими жителями, так как фамилии с суффиксом -ов у татар и башкир массово закрепились только после переписей XIX века, когда крестьян записывали по отчеству. Имя Таухутдин, хоть и звучит книжно, могло даваться в память о религиозном авторитете или просто как благопожелательное.

Сравните с однокоренными фамилиями: Таушев (от «тау» + суффикс -шев) или Хутдинов (усечённая форма без «тау»). В отличие от них, Таухутдинов сохраняет полную двусоставную основу, что делает её более узнаваемой и менее подверженной сокращениям в быту.