Фамилия Тимощеня — яркий пример того, как по суффиксу можно безошибочно определить регион происхождения. В отличие от массовых русских фамилий на -ов и -ин, форма на -еня характерна для белорусской ономастики, особенно для западных и центральных областей (Гродненская, Минская, Витебская). Такой суффикс выполняет ту же роль, что и русский -ёнок или украинский -енко: он указывал на младшего члена семьи, чаще всего на сына. Таким образом, Тимощеня — это «маленький Тимофей» или «сын Тимофея».

Основа фамилии — каноническое имя Тимофей, которое в переводе с греческого означает «почитающий Бога». В просторечии имя часто сокращалось до Тимош, Тимоха, и от этих обиходных форм образовалась целая россыпь фамилий: Тимошенко, Тимошин, Тимощук. Тимощеня стоит в этом ряду особняком благодаря своему белорусскому «окрасу». Если фамилия Тимошенко — типично украинская, то Тимощеня — её прямой белорусский аналог, причём суффикс -еня здесь звучит мягче и архаичнее, чем его украинский собрат.

Интересно, что в некоторых говорах суффикс -еня мог закрепляться не только за сыном, но и за учеником, подмастерьем или вообще за человеком, который был «при» старшем. Поэтому не исключено, что прозвище Тимощеня в XV–XVII веках мог получить не обязательно ребёнок Тимофея, а, скажем, работник в хозяйстве Тимофея — так называемый «тимофеев человек». Впрочем, основная версия — патронимическая, то есть по отцу.

Сословно фамилия Тимощеня почти наверняка крестьянская. В дворянских гербовниках она не встречается, а в метрических книгах XIX века чаще всего фиксируется у православных и униатов белорусских губерний. В отличие от фамилий на -ский, которые могли носить шляхтичи, Тимощеня — фамилия «простая», но от этого не менее древняя: она закрепилась ещё в те времена, когда у крестьянина было только имя и прозвище, а фамилию давали по отцу в третьем поколении.