Имя Тимотя, очевидно, представляет собой производную форму имени Тимофей, которое в переводе с греческого означает «почитающий Бога». Скорее всего, основатель рода Тимотиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Тимотя, со временем получил фамилию Тимотина.