Мужское крестильное имя Тимофей в переводе с древнегреческого означает «почитающий Бога». В основу фамилии легла производная форма этого имени – Тимушко. Одним из покровителей данного имени считается апостол Тимофей, ученик апостола Павла, первый епископ Эфеса. Скорее всего, основатель рода Тимушковых был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Тимушко, со временем получил фамилию Тимушков.