Фамилия Тимушкова (и её мужской вариант Тимушков) образована от народной формы крестильного имени Тимофей. В переводе с древнегреческого это имя означает «почитающий Бога», а в обиходе на Руси оно приобрело множество уменьшительных и просторечных вариантов, одним из которых стало Тимушко. Именно эта форма и легла в основу фамилии.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русского ономастикона: к основе Тимушк- добавили патронимический суффикс -ов, который указывал на принадлежность к отцу. То есть Тимушков — это буквально «сын Тимушка», а Тимушкова — его дочь или жена. Такие фамилии массово закреплялись в XV–XVII веках, когда у простых людей, не имевших родовых прозваний, появлялась необходимость передавать имя отца детям.

Покровителем имени считается апостол Тимофей, ученик апостола Павла и первый епископ Эфеса. На Руси это имя было широко распространено среди всех сословий, но форма Тимушко, с уменьшительным суффиксом -ушк-, чаще бытовала в крестьянской и посадской среде. Поэтому, скорее всего, основатель рода Тимушковых был человеком из простого сословия: земледельцем, ремесленником или мелким служилым человеком. В документах того времени фамилии с такой основой встречаются в северных и центральных уездах России, где имя Тимофей звучало особенно часто.

Интересно, что параллельно существовали и другие производные формы того же имени — Тимошкин, Тимохин, Тимаков. Фамилия Тимушков выделяется на их фоне именно архаичным суффиксом: он сохранил ту самую форму, которую в живой речи постепенно вытеснили более поздние варианты. Таким образом, фамилия Тимушкова — это не просто отсылка к имени предка, а застывший слепок разговорного языка той эпохи, когда имя Тимофей произносили на свой лад в каждом селе.