Фамилия Тимушева образована от старинного уменьшительного имени Тимуш — так в народе, в бытовом общении, звали человека с каноническим именем Тимофей. Само имя пришло на Русь из древнегреческого языка и переводится как «почитающий Бога», что в крестьянской среде часто воспринимали как пожелание благочестивой жизни. В основе фамилии лежит именно разговорная, домашняя форма, а не полное церковное имя, — и это сразу говорит о среде, где она возникла.

Судя по модели образования, фамилия Тимушева относится к типично русскому типу притяжательных фамилий на -ев/-ов. Суффикс -ев присоединялся к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или шипящий, а здесь корень Тимуш как раз заканчивается на шипящий. Первоначально форма Тимушев означала «сын Тимуша», а в женском роде — Тимушева, то есть «дочь или жена Тимуша». Такие фамилии массово закреплялись в XV–XVII веках, когда у крестьян и посадских людей вместо прозвищ стали появляться наследственные семейные именования.

Скорее всего, основатель рода Тимушевых был выходцем из крестьянской или рабочей среды. В документах той поры уменьшительные имена вроде Тимуш, Тимка, Тимоха встречаются гораздо чаще полного Тимофей, поэтому фамилия могла возникнуть независимо в разных регионах. Интересно, что однокоренные фамилии — Тимошев, Тимохов, Тимашов — тоже пошли от этих просторечных форм, но Тимушев выделяется редким для литературного языка вариантом с буквой «у» в корне, что сохранило архаичное народное произношение.

Сам по себе корень Тимуш не имеет отдельного смысла вне имени Тимофей, поэтому все версии о каком-либо тюркском или ином происхождении здесь излишни: фамилия чисто русская по словообразованию, хотя имя, лежащее в основе, греческое. Поскольку фамилия зафиксирована в женской форме Тимушева, она могла принадлежать как женщине, так и мужчине — в русской традиции женский вариант фамилии часто использовался для всей семьи в бытовых записях. Сегодня носители фамилии встречаются в разных областях России, но наибольшая концентрация традиционно отмечается на Русском Севере и в Поволжье, где уменьшительные имена на -уш держались дольше всего.