Фамилия Тохтобина — женская форма фамилии Тохтобин, которая встречается нечасто и имеет прозрачную, но неоднозначную этимологию. В её основе лежит прозвище или имя Тохтоба, которое, скорее всего, имеет тюркские корни. Разбор фамилии стоит начать с суффикса -ин: он указывает на принадлежность («чей?»), то есть Тохтобины — это потомки человека по прозвищу Тохтоба.

Самая вероятная версия связывает основу с тюркским глаголом «тохта» — «стой», «остановись». В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) имя Тохта или Тохтай было распространено как охранительное имя-оберег. Родители давали его ребёнку, чтобы обмануть злых духов: считалось, что если назвать младенца «Стой» или «Остановись», смерть или болезнь пройдут мимо, не заметив его. Таким образом, Тохтоба могло быть ласкательной или уменьшительной формой от имени Тохта (с добавлением -ба, как в именах Акба, Кутлуба). В таком случае предок носителя фамилии был татарином, башкиром или представителем другого тюркского народа, принявшим православие, — на это указывает русский суффикс -ин, который «обрусел» фамилию.

Вторая, менее популярная версия — от арабского имени Тахта (в значении «под», «низ»), но она слабая, так как не объясняет появления гласной «о» в первом слоге и не подтверждается массовым бытованием такого имени в тюркской среде.

Географически фамилия Тохтобина тяготеет к Поволжью и Уралу — регионам, где веками жили татары и башкиры в соседстве с русскими. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении: возможно, родоначальник был известен в одной деревне или слободе. Сословно предки Тохтобиных могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми (например, толмачами или казаками), поскольку в XVI–XVII веках многие тюркские имена фиксировались именно среди тех, кто нёс пограничную службу или занимался торговлей.

Если сравнить с однокоренными фамилиями — Тохтаров, Тохтамышев, Тохтахунов, — то Тохтобин выделяется суффиксом -об(а), который в тюркских именах встречается реже, чем -ай или -ар. Это делает фамилию более редкой и ценной для генеалогического поиска: найти предка с таким прозвищем в писцовых книгах или ревизских сказках проще, чем Тохтарова.