Фамилия Токтаренко образована по типичной для украинской ономастики модели: к основе Токтар- добавлен патронимический суффикс -енко. Исторически такие фамилии на -енко означали «сын такого-то» или «потомок такого-то», то есть Токтаренко — это «сын Токтаря» или «потомок Токтаря».

Разговор об основе уводит нас в тюркское наследие. Слово «токтар» (или «тохтар») в тюркских языках имеет несколько значений. Самое распространённое — «остановившийся», «задержавшийся», «постоянный». В казахском, татарском и башкирском языках «тукта» означает «стой», «остановись». Соответственно, Токтар — это человек, которому дали имя-пожелание, чтобы он был устойчивым, основательным, или же прозвище для медлительного, спокойного человека. Встречается и значение «чистый», «безупречный» (от арабского «тахар» — чистота), но для тюркских антропонимов это менее характерно.

Фамилия Токтаренко — явно позднего происхождения, сформировалась не ранее XVII века, когда фамилии на -енко стали массово закрепляться на Левобережной и Слободской Украине. Носители фамилии исторически сосредоточены в южных и восточных областях Украины, а также в прилегающих регионах России (Кубань, Ростовская область), куда переселялись запорожские и черноморские казаки. Это указывает на то, что предки Токтаренко, скорее всего, были казаками или крестьянами, жившими в зоне активных контактов с тюркским населением (крымские татары, ногайцы, турки). Само имя-прозвище Токтар могло быть получено в результате таких контактов: либо от однополчанина-тюрка, либо как прозвище, данное казаку за его спокойный нрав или внешние черты.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые распространены повсеместно, Токтаренко сохраняет чёткую региональную привязку и прозрачную внутреннюю форму. Если бы фамилия была русской, она звучала бы как Токтаров. Форма на -енко — маркер того, что фамилия оформилась именно в украинской языковой среде, и её носители, вероятнее всего, происходят из семей, где тюркское имя стало личным прозвищем, а затем передалось по наследству.