Фамилия Токтарова образована от киргизского мужского имени Токтар, которое переводится на русский язык как «останься». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Токтаровых можно лишь на основании генеалогических исследований.