Фамилия Толонников — довольно редкая и сбивающая с толку при первом взгляде. Её основа неочевидна: в ней нет привычного прозвища от ремесла или внешности, которое лежит на поверхности. Чтобы понять происхождение, нужно разобрать словообразовательную цепочку, и здесь возможны два основных пути.

Первый и самый вероятный вариант: фамилия образована от прозвища Толонник. В русских говорах, особенно северных и сибирских, «толоном» или «толокой» называли складчину, совместную работу крестьян — например, когда всем миром ставили дом или убирали урожай. Человек, который организовывал такую помощь или сам часто в ней участвовал, мог получить прозвище Толонник. Суффикс -ник в этом случае указывает на деятеля: кто-то, имеющий отношение к «толоке». Соответственно, Толонников — потомок того самого Толонника, «сын толонного человека».

Вторая версия, хотя и менее распространённая, связывает фамилию с диалектным словом «толон» — пастбище, выгон для скота. В этом случае Толонник — пастух или владелец скота, который пасся на общинном выгоне. Оба значения — и «участник толоки», и «пастух» — хорошо ложатся в крестьянскую среду, где фамилии образовывались от занятий и социальных ролей.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Толонников. Фамилия не дворянская, не семинарская, а именно народная, что подтверждается её корнями в диалектной лексике. Встречается она преимущественно в Поволжье и на Урале, где слово «толока» было особенно употребительно. Путать с фамилией Толоконников не стоит: у той основа другая — «толокно» (овсяная мука), а здесь речь идёт о действии или месте.