Фамилия Торохтунов редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы разобраться, нужно отвлечься от поиска очевидного корня вроде «торохтеть» (греметь) и посмотреть на словообразовательную модель и исторические говоры.

В основе фамилии лежит прозвище Торохтун. Суффикс -ун в русских прозвищах (как Болтун, Ворчун, Скакун) указывает на носителя действия или свойства. Торохтун — это человек, который «торохтит». В диалектах (особенно северных, уральских и сибирских) «торохтеть» означало не просто греметь, а говорить быстро, без умолку, тараторить, а также делать что-то торопливо, с шумом и суетой. Таким образом, прозвище Торохтун могли дать либо неугомонному болтуну, либо человеку суетливому и шумному в работе.

Патронимический суффикс -ов стандартно присоединился к основе, оформив фамилию как «сын Торохтуна». Интересная деталь: в некоторых говорах существовал вариант «тороктун» (от «торок» — порыв ветра, шум), но он менее распространён. Фамилия Торохтунов встречается в основном на Русском Севере (Архангельская, Вологодская области) и в Сибири, куда переселенцы принесли северный говор. Это косвенно подтверждает, что прозвище бытовало именно в северных диалектах.

Однокоренных фамилий мало, что делает Торохтунова заметной в своей локальной среде. В списках однодворцев и крестьян XVII–XVIII веков подобные прозвища встречаются эпизодически, но именно как личное прозвище, а не наследственное имя. Фамилия закрепилась, скорее всего, в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам главы семьи. Сословно — это почти наверняка крестьянский или мещанский род, без дворянских корней, так как основа прозвища бытовая и не связана с владением землёй или службой.

Если искать параллели, то по звучанию и модели ближе всего фамилии Торохтин, Торохов, Торопыгин. Но Торохтунов стоит особняком: редкий суффикс -ун в основе и яркое диалектное значение делают её «говорящей» фамилией, которая прямо называла предка — говорливого или суетливого человека.