Фамилия Тойка — один из тех редких случаев, когда написание совпадает с основой, а не с типичным фамильным суффиксом. Она застыла в форме, которая обычно встречается у кратких прилагательных или прозвищ, а не у фамилий на -ов или -ин. Это сразу наводит на мысль о её возможном происхождении из среды, где фамилии оформлялись не по великорусскому образцу, а под влиянием местных диалектов или финно-угорских языков.

Скорее всего, фамилия восходит к прозвищу Тойка. В русских говорах, особенно на Севере и в Приуралье, «тойка» могло означать «та», «эта» — указательное местоимение в женском роде, закрепившееся за человеком. Такое прозвище могли дать женщине, которую постоянно упоминали в разговоре («тойка пришла», «тойка сказала»), или же оно относилось к человеку с характерной манерой речи. Однако есть и другая версия: в некоторых диалектах «тойка» — это вариант слова «той» (пир, праздник), и прозвище могло принадлежать любителю погулять или устроителю застолий.

Ещё одно направление — финно-угорское влияние. В карельском и вепсском языках есть слово «toika» — «другой», «иной». Фамилия могла возникнуть на территории современной Карелии или Вологодчины, где русские фамилии нередко образовывались от местных прозвищ без добавления суффиксов. В таком случае Тойка — это прозвище пришлого человека, чужака, «другого» по происхождению или поведению.

Фамилия крайне редкая. Она не встречается в массовых списках дворянских или купеческих родов, не фиксируется в старых боярских книгах. Это указывает на её крестьянское или мещанское происхождение, скорее всего, из северных или северо-западных губерний. В современной России фамилия Тойка встречается единично, в основном в Карелии, Архангельской и Вологодской областях — что подтверждает версию о её диалектной или финно-угорской основе.

Однокоренных фамилий практически нет. Можно вспомнить разве что Тойкин (с суффиксом -ин, от той же основы), но и он нечаст. Сама форма Тойка без патронимического суффикса — архаичная, сохранившаяся с тех времён, когда фамилии на Руси ещё не устоялись, и человека могли записать просто по прозвищу. Это делает фамилию ценной для историков языка: она как застывший снимок живой речи прошлого.