Фамилия Трахинин — яркий пример того, как прозвище, данное человеку по его привычке или образу действий, закрепилось в родовом имени. Её основа — глагол «трахать» в одном из его старых, ныне забытых значений. В русских говорах, особенно на севере и в центральных областях, «трахать» означало «стучать, колотить, хлопать, бить». Соответственно, Траха — это прозвище шумного, суетливого человека, который постоянно что-то ронял, громко хлопал дверями или работал с таким усердием, что стоял грохот. В словаре В. И. Даля зафиксировано и слово «трах» как междометие, передающее звук удара, что только подтверждает звукоподражательную природу прозвища.

Морфологически фамилия проста: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть Трахинин — это «сын Трахини» или, в более архаичном варианте, «сын Трахи». Форма Трахиня, от которой и пошла фамилия, скорее всего, появилась как ласкательный или уменьшительный вариант прозвища Траха, что было обычной практикой в русской антропонимии. Таким образом, исходная цепочка выглядит так: прозвище Траха (стук, грохот) → полуотчество Трахиня (сын Трахи) → фамилия Трахинин.

Встречаются и альтернативные версии, но они менее убедительны. Иногда корень «трах-» связывают со словом «трахнуть» в значении «выпить спиртного» (ср. «трахнуть по рюмке»). Однако это значение более позднее и просторечное, а прозвища чаще всего давались по устойчивым, бытовым приметам, а не по эпизодическим действиям. Версия с «грохотом» и «стуком» выглядит исторически первичной.

Географически фамилия Трахинин редкая. Основные очаги её бытования — это Вологодская и Архангельская области, а также Поволжье (например, Нижегородская область). В этих регионах, где говор сохранил множество древних слов и значений, прозвище Траха было вполне понятно окружающим. Предок-носитель такой фамилии мог быть плотником, кузнецом или просто человеком с тяжёлой поступью и громким голосом — в любом случае, его «шумная» характеристика оказалась настолько яркой, что пережила столетия.