Основой фамилии Трефелова послужило церковное имя Трифилий. Мужское крестильное имя Трифилий в переводе с древнегреческого означает «трилистник». В основу фамилии легла производная форма этого имени – Трефел. Одним из покровителей данного имени является святитель Трифилий, епископ Левкуссии Кипрской. Скорее всего, основатель рода Трефеловых был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Трефел, со временем получил фамилию Трефелова.