Фамилия Трихоненко — характерный пример украинской фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -енко. Эта модель была и остаётся самой массовой в Украине: суффикс «-енко» буквально означает «маленький» или «сын», то есть Трихоненко — это «сын Трихона». Выходит, что в основе фамилии лежит личное имя Трихон.

Имя Трихон — это народная, разговорная форма канонического имени Тихон. В русской и украинской традиции звук «х» в бытовой речи часто заменял или смещался: Тихон превращался в Трихон (ср. Фёдор — Хведор). Само имя Тихон имеет греческое происхождение и переводится как «удачливый», «счастливый». Таким образом, далёкий предок носителя фамилии Трихоненко был сыном человека по имени Тихон (в просторечии — Трихон).

Географически фамилия Трихоненко тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине, Черкащине и Слобожанщине. Встречается она и на юге России, в регионах, где исторически была велика доля украинского населения (Кубань, Ростовская область). В России фамилия могла видоизменяться: например, при записи в документы XIX века «Трихоненко» могли «обрусить», добавив окончание -ов, что дало бы фамилию Трихоненков, но исходная форма сохранилась в большинстве случаев.

Интересная деталь: в отличие от многих украинских фамилий на -енко, которые образованы от мирских имён или прозвищ (например, Бондаренко — от бондарь), Трихоненко — чисто «именная» фамилия. Она не указывает на ремесло или внешность предка, а только на его родство. Это значит, что основатель фамилии, скорее всего, не выделялся никаким особым занятием — его просто «записали по отцу». Такие фамилии часто возникали в среде крестьян и казаков, где официальная фамилия могла закрепиться только в XIX веке, после отмены крепостного права, а до того человека называли по отцу: «Трихоненко» — то есть «Трихонов сын».