Фамилия Тройницкий в большинстве случаев восходит к названию праздника Святой Троицы или к многочисленным сёлам и слободам, которые называли Троицкими — как правило, по стоявшей в них церкви. Если в основе лежит топоним, то основатель рода был либо уроженцем такого села, либо долго там жил, и земляки прозвали его по месту жительства. Однако есть и третья версия, менее очевидная: в основе фамилии могло лежать прозвище Тройний. Так в народе нередко называли третьего ребёнка в семье или, наоборот, многодетного отца, у которого «трое и больше» детей.

Обратим внимание на суффикс. Форма Тройницкий образована не по самой частотной модели с -ов/-ев, а по модели притяжательных прилагательных на -ский/-цкий. Такие фамилии обычно указывали на связь с географическим объектом или на принадлежность к месту, поэтому версия о происхождении от названия села Троицкое выглядит предпочтительнее прозвищной. Тем не менее, прозвище Тройний тоже могло дать начало фамилии, если его носитель переезжал и его дети или внуки закрепляли за собой форму на -ский по аналогии с другими фамилиями той эпохи.

Процесс формирования фамилий в России был долгим и неравномерным, поэтому точно определить время и место возникновения рода Тройницких можно только на основании серьёзных генеалемических исследований. Показательно, что похожая ситуация складывалась и с другими фамилиями: например, от нарицательного «роза» возникала фамилия Розов, а не Розин, хотя по правилам русского языка суффикс -ов присоединяется к словам мужского рода. Это напоминает о том, что народная словообразовательная логика часто побеждала книжные нормы.

Отдельного упоминания заслуживает тот факт, что некоторые Тройницкие принадлежали к нетитулованному российскому и малороссийскому дворянскому роду. Герб этого рода внесён в 15-ю часть «Общего гербовника дворянских родов Российской империи», что служит документальным подтверждением существования дворянской ветви. Впрочем, однофамильцы из крестьянских и мещанских сословий могли не иметь к этому роду никакого отношения, и их фамилия возникала самостоятельно — от того же праздника, села или прозвища.