Фамилия Трушаковы происходит от просторечной формы Трушак, которая, в свою очередь, восходит к каноническому имени Трифон. Имя Трифон пришло на Русь вместе с христианством из Византии и образовано от древнегреческого слова tryphon, что означает «изнеженный». Так что, вопреки возможному впечатлению, ничего общего с «трухой» или «трусить» эта фамилия не имеет — её корень чисто греческий, а в русский язык он попал через церковные святцы.

Покровителем имени считается Святой мученик Трифон. По житию, он происходил из простых поселян и в молодости пас гусей, а позже обратил ко Христу множество язычников. Эта деталь важна для понимания социального контекста фамилии: Трифон был крестьянским святым, близким простому народу, поэтому и его имя в народной среде употреблялось охотно.

Сама модель образования фамилии — через уменьшительную форму Трушак и патронимический суффикс -ов — говорит о том, что предки Трушаковых не принадлежали к знати. В старину фамилии от полной формы имени (Трифонов) получала в основном социальная верхушка или семьи с большим авторитетом в округе. Простых людей чаще называли обиходными, производными именами — так Трифон в крестьянской среде превратился в Трушака, а его потомки стали Трушаковыми.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и в разных регионах он шёл с разной скоростью. Однако то, что фамилия сохранила именно народную, разговорную форму имени, а не книжную, — само по себе ценный след истории. Трушаковы — это памятник не столько славянской письменности, сколько живой народной речи, которая перекроила греческое имя на свой лад и закрепила его в родовом прозвании.