Фамилия Центю — редкий пример, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает любые другие версии. Она явно украинская или южнорусская, и сконцентрирована на западе Украины, в частности в Закарпатье и соседних областях. Встречается она настолько редко, что в общероссийских базах данных её почти нет — это локальная, «гнездовая» фамилия.

С точки зрения словообразования, фамилия Центю — это патроним (отчество) в форме родительного падежа единственного числа. Суффикс -ю (вместо более привычного -а) характерен для украинской модели образования фамилий от имён, оканчивающихся на мягкий согласный или -й. То есть «Центю» буквально значит «чей?» — «Центя», «сын Центя». Основа здесь — личное имя или прозвище Цент.

Самая вероятная версия происхождения этого имени — от глагола «центить» или «центать», который в западных говорах означал «цедить», «процеживать», «лить тонкой струёй». Прозвище Цент могли дать человеку с тягучей, медленной речью или тому, кто занимался переливкой жидкостей, например, самогонщику или работнику на сыроварне. В польском языке есть слово «cętka» — крапинка, пятнышко, что тоже могло стать основой прозвища для рябого или веснушчатого человека. Но украинская огласовка с ударением на последний слог (Центю́) склоняет к версии с глаголом.

Вторая, менее вероятная гипотеза — связь с немецкой фамилией Zenz или Zentz, которую могли принести в Галицию колонисты-ремесленники. В таком случае фамилия могла быть адаптирована на украинский лад: Zentz → Ценц → Центю. Но без документальных подтверждений эта версия остаётся догадкой.

Социально носители фамилии Центю, скорее всего, происходили из крестьян или мещан западноукраинских сёл. В дворянских родословных книгах Российской империи эта фамилия не зафиксирована — она слишком локальна и поздняя по времени оформления (XIX — начало XX века).