Фамилия Ципухин — редкий пример отчества от прозвища, образованного по модели, характерной для северных и сибирских говоров. В основе лежит слово «ципуха» — диалектное название мелкой рыбы, чаще всего уклейки или пескаря. В некоторых областях «ципухой» называли также небольшую щепку, занозу или вообще что-то мелкое и незначительное. Прозвище Ципуха могли дать человеку невысокого роста, худощавому или, в ироничном ключе, рыболову, который промышлял только мелкой рыбой.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Ципухин буквально означает «сын Ципухи». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ или имен, оканчивающихся на -а, -я. В отличие от более распространённых -ов/-ев, фамилии на -ин встречаются реже и часто сохраняют связь с конкретным, нередко ироничным прозвищем родоначальника.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркским корнем. В некоторых тюркских языках «цип» или «чип» означает «предел», «граница», а с суффиксом -ух могло образоваться прозвище человека, жившего на краю селения или на границе земель. Однако эта гипотеза не подкрепляется широкой географией фамилии: основные очаги Ципухиных — Вологодская, Архангельская и Кировская области, то есть регионы русского Севера, где диалектная лексика преобладает.

Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская по происхождению. В документах XVII–XVIII веков Ципухины встречаются среди черносошных крестьян и посадских людей северных уездов. Старообрядческая среда также могла способствовать сохранению фамилии: на Севере староверы часто держались замкнуто, и прозвища переходили в фамилии без изменений.

Интересно, что фамилия практически не встречается за пределами России и не имеет однокоренных аналогов в других славянских языках. Это указывает на узколокальное происхождение. Если вы Ципухин, ваши предки с высокой вероятностью жили в междуречье Северной Двины и Вятки, занимались рыболовством или земледелием, а фамилия закрепилась за ними по прозвищу, данному за невысокий рост или за привычку ловить мелкую рыбу.