Фамилия Цыберкин — редкий пример, где основа почти наверняка не русская, а германская или еврейская, а вот оформление — чисто русское, с типичным суффиксом принадлежности -ин. Чтобы понять её происхождение, стоит начать с корня «цыбер-» и посмотреть, что за слово могло дать прозвище.

Самая вероятная версия отсылает к немецкому слову Zieber или Zibber. В диалектах немецкого языка так называли дрожащего, зябкого человека или того, кто постоянно суетится, трясётся от холода или страха. В славянской среде такое прозвище мог получить либо выходец из немецких колоний (их было много в Поволжье и Прибалтике), либо местный житель, которого за характер прозвали «дрожалкой» на немецкий манер. Суффикс -кин в таком случае указывает на то, что фамилия образована от прозвища отца: Цыберка — так на русский лад переделали немецкое прозвище, а его сын стал Цыберкиным.

Есть и вторая, менее очевидная версия — от еврейского имени Цви (Цыби), что означает «олень» или «газель». В этом случае Цыберкин — это русифицированная форма фамилии, где к основе Цыбер- (искажённое Цви) добавили русский патронимический суффикс. Такие фамилии встречались в черте оседлости, особенно в Белоруссии и на Украине, где еврейские имена активно переделывались под местные словообразовательные модели.

Географически фамилия Цыберкин — редкая, с заметным следом в западных и южных регионах бывшей Российской империи: встречается в документах по Могилёвской, Витебской, а позже и по Оренбургской губерниям. Это косвенно подтверждает обе версии — и немецкую (колонии на юге и западе), и еврейскую (черта оседлости). Сословно носители фамилии, скорее всего, были мещанами или государственными крестьянами — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Обратите внимание на написание: через «ы», а не «и» — Цыберкин, а не Циберкин. Это типично для русской передачи иноязычных основ после ц, где «ы» подчёркивает твёрдость произношения. Если бы фамилия была образована от имени Цибирий или другого греческого корня, скорее всего, писали бы через «и». Так что «ы» — дополнительный аргумент в пользу того, что корень народный, диалектный, а не книжный.