Фамилия Цыганкина образована по самой распространённой в русском языке модели — с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — «Цыганкина». Это женская форма, а мужская, соответственно, Цыганкин. В основе лежит прозвище или мирское имя Цыганка, которое давали человеку за смуглый цвет кожи, тёмные волосы, склонность к кочевому образу жизни или за какой-то поступок, напоминавший о цыганах.

Суффикс -к- в слове «Цыганка» — не уменьшительно-ласкательный (как в «ручка» или «ножка»), а скорее прозвищный. В русских говорах и в документах XVI–XVII веков «цыганкой» могли назвать женщину с характерной внешностью или повадками, а мужчину — «цыганом». Фамилии на -ин в этом случае типичны для северных и центральных областей России, где активно использовалась притяжательная форма: «чей сын?» — «Цыганкин».

Интересно, что фамилия Цыганкина не обязательно указывает на цыганское происхождение. В крестьянской среде прозвище часто давали по внешнему признаку: чернявый, курчавый, смуглый. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне с прозвищем Цыган, которые не имели никакого отношения к цыганскому этносу. Так что предки носительницы фамилии с высокой вероятностью были русскими крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище за внешность или характер.

Редкость фамилии в том, что она сохранила форму с суффиксом -к- в основе, не перейдя в более привычную Цыганов или Цыганский. Это говорит о том, что имя Цыганка было самостоятельным и употребительным, а не просто производным от «цыган». В современных справочниках фамилия Цыганкина встречается нечасто, сосредоточена в основном в Поволжье и центральных регионах России.