Фамилия Туктарева — женская форма фамилии Туктарев, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Туктарь. Основа здесь тюркская, и чтобы понять её смысл, нужно разобрать два компонента. Первый — «тук-» (или «тукы-») в тюркских языках часто означает «родился», «рождённый». Второй — «-тарь», скорее всего, восходит к слову «тар» («узкий», «тесный») или к имени Тари (как часть сложного имени). Самая вероятная версия: Туктарь — это диалектная или упрощённая форма тюркского имени Туктагул, что значит «рождённый рабом» или «рождённый слугой». В кочевых обществах такое имя могли дать ребёнку, чтобы «обмануть» злых духов: мол, ребёнок незначителен, не нужен, — и тем самым защитить его от сглаза.

Модель образования фамилии — стандартная для русского быта: к основе на -ь добавили притяжательный суффикс -ев (Туктарь → Туктарев). Суффикс -ин здесь был бы неуместен, потому что основа не на -а/-я. Такие фамилии массово возникали у крещёных татар, башкир и других народов Поволжья в XVI–XIX веках, когда их вносили в ревизские сказки и метрики. Священники или писаря русифицировали тюркское имя, добавляя русское окончание.

У фамилии есть и более прозаичная версия происхождения, без мистики. Слово «туктарь» могло быть прозвищем человека, который постоянно «туктал» — то есть запинался, заикался или медлил. В татарском языке «туктау» — «остановиться», «замереть». Если прозвище дали за манеру говорить или ходить с паузами, то фамилия получилась бы «остановочной» по смыслу. Эта версия слабее, потому что прозвища редко становились основой для фамилий без личного имени, но полностью исключать её нельзя.

Географически фамилия Туктарева встречается в основном в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — там, где исторически селились тюркские народы. В дореволюционных списках она редка, что говорит о её позднем оформлении (скорее всего, вторая половина XIX века). Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — предки были либо государственными крестьянами, либо тептярами (сословие нерусских народов Поволжья).

Отдельного разбора заслуживает ударение. В русском быту фамилию чаще произносят с ударением на второй слог: Тукта́рева. Но в тюркском оригинале ударение тяготеет к последнему слогу: Туктарева́. Это не ошибка, а следствие адаптации: русский язык «перетянул» ударение по своей привычной модели (как в фамилиях на -арев: Косарев, Булгарев).