Фамилия Тунка — редкий случай, когда географическое название могло перейти в фамилию почти без изменений. В основе лежит слово «тунка», которое в некоторых говорах означало «тупик», «глухой переулок» или «закоулок». Человек, живший в таком месте, получал прозвище Тунка, которое затем закрепилось за его потомками. Однако это не единственная версия.

Более вероятно, что фамилия имеет топонимическое происхождение. В Сибири существует река Тунка и известный посёлок Тунка в Бурятии. Житель этой местности или выходец оттуда легко мог получить прозвище по названию родных мест — Тунка. Учитывая, что фамилия встречается преимущественно в Восточной Сибири и на Дальнем Востоке, эта версия выглядит убедительнее бытовой.

Модель образования проста: фамилия не получила дополнительных суффиксов (как -ов или -ин), а осталась в форме чистого прозвища. Такое оформление характерно для украинских и белорусских фамилий, а также для ранних русских прозваний, которые позже не «русифицировались» добавлением -ов. В данном случае фамилия Тунка могла принадлежать и крестьянину, и казаку, и ссыльному поселенцу — сословной привязки нет.

Встречается и более редкое толкование: от тюркского «тун» (ночь) или «тунг» (замерзший), но для русской фамилии это натяжка. Скорее всего, перед нами именно географическое прозвище, которое закрепилось в форме, удобной для бытового общения, и не менялось веками.