Мужское крестильное имя Тимофей в переводе с древнегреческого языка означает «почитающий бога». В основу фамилии легла польско-украинская уменьшительная форма имени, которая звучит как Тышко. Скорее всего, основатель рода Тышковских был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Тышко, со временем получил фамилию Тышковский.