Фамилия Тюпакова — женская форма фамилии Тюпаков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Тюпак. В основе лежит слово «тюпать»: в русских говорах так называли медленную, вялую походку или само действие — идти не спеша, шаркать. Соответственно, Тюпаком могли прозвать человека медлительного, неповоротливого или того, кто ходил вразвалку.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов присоединялся к основе на твёрдый согласный. Тюпак → Тюпаков → Тюпакова. Такая схема указывает на то, что фамилия сформировалась в среде крестьян или посадских людей, преимущественно на севере и в центральной России, где прозвищные фамилии были особенно распространены.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным «тюпа» — так в некоторых областях называли шапку или колпак. В этом случае Тюпак мог быть прозвищем мастера по изготовлению головных уборов или человека, который постоянно носил какую-то приметную шапку. Но лингвистически первая версия надёжнее: глагольная основа «тюпать» даёт больше производных в говорах, чем предметное «тюпа».

Фамилия не относится к числу дворянских или именитых. Её носители — потомки крестьян, ремесленников или служилых людей низших чинов. Географически Тюпаковы встречаются в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает связь с севернорусскими говорами, где слово «тюпать» фиксируется в диалектных словарях.

В написании возможна путаница с фамилией Тюпакова через «ё» (Тюпёкова), но это разные ономастические гнёзда: форма с «ё» обычно восходит к имени Тюпа (от греческого Тихон или уменьшительного от Степан). Для фамилии Тюпакова вариант с «я» — основной и единственно верный.