Фамилия Уфандеева — редкий случай, когда географическая основа очевидна, а способ её оформления в фамилию нестандартен. В основе лежит название города Уфа. Но если бы фамилию образовали по обычной модели, мы бы имели дело с Уфимцевым или Уфинским. Здесь же работает тюркский формант -деев, который встречается в фамилиях, восходящих к башкирским и татарским именам или прозвищам (ср. Мурзадеев, Бекдеев). Получается, что носитель фамилии — это «человек из Уфы», но названный по-восточному: «уфинец» через тюркский патронимический суффикс.

Исходное прозвище Уфандей (или Уфандай) могло означать «уфимец», «тот, кто родом из Уфы». В русской среде такое прозвище давали переселенцам, переехавшим из башкирского края в центральные или северные губернии. Фамилия закрепилась в форме женского рода Уфандеева, что типично для окончания -а: в документах XIX века женская форма нередко фиксировалась как основная, если запись делали со слов вдовы или дочери.

С точки зрения словообразования перед нами гибрид: русская основа «Уф-» и тюркский суффикс -андей/-андай (уменьшительно-притяжательный). Полная форма — Уфандеев — встречается редко, а Уфандеева — ещё реже. Фамилия практически не выходит за пределы Оренбургской области и Башкортостана, что подтверждает её локальное происхождение.

В словарях русских фамилий (Унбегаун, Никонов) эта фамилия не упоминается — она относится к числу микрорегиональных, не попавших в общероссийские списки. Её носители, скорее всего, были выходцами из мещан или государственных крестьян, переселившихся в XIX веке из Уфы в соседние уезды. Мужская форма Уфандеев могла бы звучать как Уфандеев, но в быту закрепился именно женский вариант, возможно, из-за того, что первую запись в метрической книге сделали по матери-одиночке.