Фамилия Урупко — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ко характерен для украинских и южнорусских фамилий, часто указывает на уменьшительную или «сыновью» форму. Однако корень «Уруп» не встречается ни в православных святцах, ни в славянских прозвищных словарях. Зато он совпадает с названием реки Уруп — левого притока Кубани, протекающей по территории Карачаево-Черкесии, Краснодарского края и Адыгеи.

Вероятнее всего, фамилию получил человек, живший на берегу этой реки или выходец с тех мест. В казачьей среде Кубани и Терека было распространено называть переселенцев по гидронимам: так появлялись Лабинцевы, Кубановы, Урупские. Форма Урупко — более короткая, народная, без суффикса -ск-, что типично для фамилий, сложившихся в бытовой речи, а не в канцелярии. То есть носитель фамилии — потомок кубанского или терского казака, чей предок получил прозвище по месту службы или жительства.

Менее убедительная версия выводит основу из тюркского «уруп» — «удар», «бить». В этом случае прозвище Уруп мог получить человек с тяжёлой рукой, драчун или, наоборот, тот, кто работал с молотом — кузнец. Но тюркские корни в фамилиях славянского суффикса -ко встречаются редко, обычно они оформляются через -ов/-ев. Поэтому версия с рекой Уруп выглядит и логичнее, и исторически обоснованнее.

Встречаемость фамилии невысокая, сосредоточена на юге России — в Краснодарском и Ставропольском краях, Ростовской области. В документах XIX века Урупко почти не фиксируются среди крестьян центральных губерний, что косвенно подтверждает казачье происхождение. Фамилия не дворянская, не купеческая — типичная для рядовых казаков и однодворцев, которые осваивали предгорья Кавказа.