Фамилия Устаханова — женская форма фамилии Устаханов, и её ключ к происхождению лежит в мужском личном имени Устахан. Это составное имя тюркского происхождения, где первая часть «уста» восходит к слову «уста» (мастер, умелец, искусный ремесленник), а вторая — «хан» (властитель, правитель). Таким образом, имя Устахан буквально означает «мастер-хан» или «искусный правитель». В тюркской ономастике такие составные имена с компонентом «хан» были распространены как знак уважения и пожелания благородства, а не обязательно указывали на реальный титул.

Фамилия образована по русской модели: к основе Устахан добавили патронимический суффикс -ов, который в женском роде принимает форму -а. Такое оформление характерно для фамилий, возникших в среде, где русская административная система фиксировала имена и прозвища нерусских народов. Вероятнее всего, предок носителя фамилии Устаханов был человеком, которого в округе знали как Устахана — либо по имени, данному при рождении, либо по прозвищу за выдающееся мастерство.

Географически фамилия Устахановы тяготеет к Северному Кавказу и Поволжью, особенно к регионам с тюркоязычным населением: Дагестан, Чечня, Ингушетия, Татарстан, Башкортостан. Среди кумыков, чеченцев, ингушей и татар имя Устахан встречается как личное, и от него закономерно возникли фамилии. Встречаются также варианты написания Устаханов/Устаханова, и в некоторых случаях фамилию могли записать с «х» вместо «к» из-за особенностей местного произношения.

Словообразовательная модель здесь проста, но показательна: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Устаханов — «сын Устахана». Это типичная для XIX–XX веков практика, когда при переписях и паспортизации людей записывали по отцу, и прозвище или имя отца становилось наследственной фамилией. Социальный контекст: носители фамилии могли быть из среды ремесленников, кузнецов, ювелиров — тех, кого называли «уста» (мастер), но имя Устахан мог получить и человек, не связанный с ремеслом, а просто носивший почётное имя.

В ономастических справочниках фамилия Устаханов не относится к числу широко изученных, но её разбор по компонентам не оставляет сомнений в тюркской основе. Если сравнивать с однокоренными, то можно вспомнить фамилии Устаев (от имени Устай) или Устаев, Устабеков — все они строятся вокруг того же корня «уста», что подтверждает связь с идеей мастерства и уважения.