Фамилия Вагасян — редкий пример фамилии, в которой почти не осталось следов исходного слова, но зато хорошо видна модель образования. Суффикс -ян однозначно указывает на армянское происхождение: в армянской ономастике -ян (и его вариант -янц) означает принадлежность к роду, то есть «из рода Вагаса» или «сын Вагаса».

Основа «Вагас» — вот главная загадка. Прямого соответствия в армянском языке нет. Самое правдоподобное объяснение: это вариант имени или прозвища, восходящего к Ваханг — армянскому божеству-драконоборцу, которое позже вошло в мужские имена (Вахан, Ваан). Фонетически переход Вахан → Вагас возможен через диалектное смягчение или влияние тюркских языков, где «х» часто переходит в «г». Вторая версия — от тюркского слова «вага» (что-то вроде «крик», «шум»), но она слабее, так как фамилия чисто армянская по суффиксу, и тюркская лексика редко ложится в основу армянских родовых имен.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии Вагасян жил в Западной Армении или в регионе исторической Киликии, где были распространены диалектные формы имени Вахан. Носители фамилии могли быть ремесленниками, торговцами или крестьянами — сословной привязки эта фамилия не несет, так как -ян не был привилегированным суффиксом, его носили все слои армянского общества.

Любопытная деталь: фамилия Вагасян почти не встречается в современной Армении, зато фиксируется в диаспорах — в России, Грузии и странах Ближнего Востока. Это говорит о том, что род мог покинуть историческую родину во время геноцида армян или в более ранние миграции. Однокоренные фамилии — Ваганян, Ваганов (русифицированная форма) — встречаются чаще, но Вагасян сохранил более архаичную основу.