Фамилия Вахлюева образована от прозвища или нецерковного имени Вахлюй. Основа — диалектный глагол «вахлять», который в разных говорах означал «медленно, неловко делать», «работать спустя рукава», а также «шататься без дела». Вахлюем в северных и сибирских областях называли нерасторопного, вялого человека или же того, кто любил побездельничать. Слово это звукоподражательное, сродни «вахлак» — неуклюжий, грубоватый человек.

Модель образования проста: к основе Вахлюй добавили суффикс -ев, а окончание -а указывает на принадлежность к женской линии. В русской традиции фамилии на -ев/-ов чаще всего получали от имени или прозвища отца: Вахлюев — сын Вахлюя. Женская форма Вахлюева закрепилась как стандартный вариант для женщин, хотя исторически её носили и дочери, и жёны.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в Вологодской, Архангельской областях и в Сибири — именно там, где бытовало слово «вахлять». В центральных губерниях она почти не фиксируется, что указывает на локальное происхождение прозвища. Сословно предки Вахлюевых, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми — фамилия не несёт дворянского или духовного оттенка.

Интересная деталь: в некоторых говорах «вахлюй» могло быть ироничным прозвищем рыбака, который «вахляет» сети — то есть чинит их медленно, неспешно. Но основная версия остаётся бытовой, с оттенком лёгкого пренебрежения к медлительности. В современном языке фамилия звучит необычно, но сохраняет колорит северной народной речи.