Фамилия Вахтина образована от имени Вахтя — разговорной формы крестильного мужского имени Вахтисий. Это имя имеет персидские корни и переводится на русский язык как «счастливый». Скорее всего, основатель рода Вахтиных был человеком из простого сословия: фамилии на -ин в русской традиции чаще всего получали от имени отца, и в данном случае это имя было Вахтя. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Вахтин», то есть сын или потомок Вахти. Со временем, когда фамилия закрепилась, форма Вахтина (как вариант для женщин или в родительном падеже) стала самостоятельной фамилией, хотя исторически она восходит к мужской основе.

Интересно, что имя Вахтисий — редкое даже для церковного календаря. В святцах оно встречается нечасто, что делает фамилию Вахтина относительно немногочисленной и узко локализованной. В отличие от более распространённых фамилий на -ов, модель на -ин в этом случае подчёркивает, что прозвище или имя предка заканчивалось на -а или -я. Таким образом, потомок человека по имени Вахтя со временем получил фамилию Вахтина, и в ней сохранилась память о редком персидском имени, которое когда-то давали с пожеланием счастья.