Фамилия Ванторин образована от старинной русской уменьшительной формы имени Иван — Вантора. Каноническая форма этого имени — Иоанн, в переводе с древнееврейского означающая «милость Божья». От имени Иван в народе возникло множество производных форм: Ивась, Иваш, Ваня, Ванечка, Ванюта, Ванята, Ванюга, Вантей и, в том числе, Вантора.

Словообразовательная модель фамилии проста и прозрачна: к основе Вантор- добавляется типичный русский притяжательный суффикс -ин. Он указывает на принадлежность: Ванторин буквально означает «сын Ванторы» или «потомок Ванторы». Такая модель — одна из самых распространённых в русской ономастике, наряду с фамилиями на -ов/-ев.

Интересно, что форма Вантора — не единственная в этом ряду. Встречаются также фамилии Ваничкин, Ванютин, Вантеев — все они восходят к разным народным вариантам имени Иван. Но Ванторин стоит особняком: корень Вантор- встречается реже, чем, скажем, Ваня или Ванюта. Это делает фамилию более редкой и локальной. Вероятнее всего, она закрепилась в определённой местности, где прозвище или некалендарное имя Вантора было в ходу у нескольких поколений одной семьи.

Таким образом, предок носителя фамилии Ванторин с большой долей вероятности носил имя Вантора. Со временем это личное имя перешло в фамилию, закрепившись за потомками без изменений.