Фамилия Ванюшенков — одна из тех, что построена по простой и ясной модели: личное имя плюс несколько суффиксов, каждый из которых что-то говорит о происхождении. В основе лежит имя Ванюша — ласковая, обиходная форма от крестильного имени Иоанн. В переводе с древнееврейского Иоанн означает «милость Божья», но в русском быту это имя превратилось в самое массовое мужское имя — Иван. На протяжении нескольких столетий, с XVI по XIX век, среди крестьян имя Иван носили от 15 до 25 процентов всех мужчин, так что и производных фамилий от него возникло огромное множество.

Ванюша — уменьшительная форма, а суффикс -енк- в середине фамилии указывает на украинское или белорусское происхождение основы. В тех краях суффикс -енко означает «маленький», «сын» или «потомок»: Ванюшенко — буквально «Ванюшин сын» или «потомок Ванюши». Когда носители такой фамилии оказывались на великорусской территории, фамилию нередко русифицировали, добавляя стандартный русский суффикс -ов. Так Ванюшенко превратился в Ванюшенкова.

По сословной принадлежности можно предположить, что основатель рода был выходцем из крестьянской или рабочей среды — именно в этих слоях фамилии на -енко, адаптированные под русскую модель, встречались особенно часто. Ванюшенковы — не дворянский род, а типичная фамилия, возникшая в среде простых людей, где имя Ванюша было привычным и повседневным.