Фамилия Ванюжина представляет собой фонетический вариант фамилии Ванюшина, которое ведет свое начало от имени Ванюша. Имя Ванюша является производной формой имени Иван (каноническая форма Иоанн), которое в переводе с древнееврейского языка означает «милость Божья». От имени Иван было образовано множество уменьшительных форм: Ивась, Иваш, Ваня, Ванечка, Ванюта, Ванята, Ванюга, Вантей, Вантора, Вантяха, Ванура, Ванчуг, Ванчур, Ваныш, Ванюша и другие. Скорее всего, основатель рода Ванюжиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ванюша, со временем получил фамилию Ванюжина.