Фамилия Ванюжина — это не просто вариант, а результат живого звукового изменения в речи. Она восходит к фамилии Ванюшина, где звук «ш» под влиянием соседних гласных или диалектного произношения перешёл в более мягкий «ж». Такая замена («ш» на «ж») встречается в русских говорах и в фамилиях, образованных от уменьшительных форм имён.

В основе обеих фамилий лежит имя Ванюша — одна из множества производных форм имени Иван (каноническая форма Иоанн). В переводе с древнееврейского оно означает «милость Божья». Иван было самым распространённым мужским именем на Руси, и от него образовалось огромное количество уменьшительных вариантов: от привычных Ваня и Ванечка до редких Вантора, Вантяха, Ванчуг и Ванюша. Последняя форма — ласковая, домашняя, типичная для простонародной среды.

Фамилия Ванюжина закрепилась в тех регионах, где «шепелявые» или смягчающие говоры были нормой. Скорее всего, основатель рода Ванюжиных был человеком из простого сословия — крестьянином или ремесленником, которого в быту звали Ванюша. Со временем его дети и внуки получили прозвание по отцу: сначала «Ванюжин сын», а затем и просто фамилия Ванюжин (в женском роде — Ванюжина).

Интересно, что фамилия Ванюжина встречается реже, чем исходная Ванюшина. Это говорит о том, что фонетический сдвиг произошёл не повсеместно, а закрепился в отдельных локальных группах. Таким образом, носительницы этой фамилии могут проследить свои корни к конкретной местности, где говорили «Ванюжа» вместо «Ванюша».