Фамилия Ванюшина образована от имени Ванюша — уменьшительной формы имени Иван. Иван, в свою очередь, восходит к каноническому Иоанн, которое в переводе с древнееврейского означает «милость Божья». Имя Ванюша было распространено в народной, бытовой среде, а не в книжной или церковной традиции. Поэтому основоположник рода Ванюшиных, скорее всего, происходил из простого сословия — крестьян, ремесленников или посадских людей.

Фамилии на -ин в русской традиции обычно указывали на принадлежность: Ванюшина — буквально «дочь (или жена) Ванюши», а в более широком смысле — «из семьи Ванюши». Такая модель была характерна для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на -ов, особенно если основа оканчивалась на -а или -я. Таким образом, Ванюшина — типичная русская фамилия, закрепившаяся за потомками человека, которого в быту звали Ванюшей.