Имя Ванюша является производной формой имени Иван (каноническая форма Иоанн), которое в переводе с древнееврейского означает «милость Божья». Скорее всего, основатель рода Ванюшиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ванюша, со временем получил фамилию Ванюшина.