Фамилия Ванюшова образована от имени Ванюш — уменьшительно-ласкательной формы крестильного мужского имени Иоанн, которое в переводе с древнееврейского означает «милость Божья». В русском быту полное церковное имя Иоанн дало десятки народных вариантов: Иван, Ваня, Ванюша, Ванютя, Ванюха, а форма Ванюш — одна из тех, что возникла в северных и центральных говорах, где суффикс -юш- придавал имени ласковый оттенок. Потомок человека по имени Ванюш со временем получил фамилию Ванюшов (в женском роде — Ванюшова), и это типичная для русских фамилий модель: основа на твёрдый согласный плюс суффикс -ов/-ев, указывающий на принадлежность («чей?» — «Ванюшов сын»).

Интересная деталь: фамилия Ванюшова встречается реже, чем более привычные Ванюшин или Ванюшков. Дело в том, что суффикс -ов присоединяли обычно к основам на -а, -я или к полным формам имени (Иванов), а вот к краткой форме Ванюш — нечасто, поскольку она сама по себе была малоупотребительна в официальных документах. В переписных книгах XVII–XVIII веков можно найти скорее Ванюшиных — от отчества Ванюшин. Поэтому Ванюшова — вариант более редкий, локальный, возможно, закрепившийся в какой-то одной местности, где имя Ванюш бытовало как самостоятельное прозвище или нецерковное имя.

Географически фамилия Ванюшова тяготеет к центральным и поволжским областям России. По данным современных телефонных справочников и баз ЗАГС, чаще всего она встречается в Нижегородской, Владимирской и Ивановской областях, а также в Чувашии. В этих краях имя Иван и его производные были особенно популярны в крестьянской среде, и фамилии от уменьшительных форм возникали естественным путём, без участия приказных писарей, которые предпочитали стандартное Иванов.

С точки зрения социального происхождения носители фамилии Ванюшова почти наверняка принадлежали к крестьянскому или мещанскому сословию. В дворянских родословных книгах эта фамилия не зафиксирована — слишком простонародна основа. Ванюшовы не владели поместьями, не служили воеводами, а были пашенными крестьянами, ремесленниками или мелкими торговцами. Фамилия закрепилась за потомками, когда в XIX веке в России началась массовая фиксация фамилий у податных сословий, и выбор пал на ту форму, которую использовали в деревне: не Иванов, а Ванюшов — по имени, которым человека звали в семье и в общине.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Ванюшова стоит в одном ряду с Ванютиным, Ванюхиным, Ванюшкиным — все они образованы от разных уменьшительных вариантов того же Ивана. Но Ванюшова выделяется тем, что основа не содержит суффикса -к- или -т-, а значит, форма Ванюш могла быть не только ласкательной, но и прозвищной: так могли называть человека, который постоянно ходил с улыбкой или обладал мягким характером — по созвучию с глаголом «ванькать» (шалить, дурачиться) в некоторых говорах. Впрочем, это лишь гипотеза: основная и самая надёжная версия — от имени Иоанн через цепочку Иван → Ваня → Ванюш.