Фамилия Варфлусев образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Варфлусев послужило церковное имя Варфоломей. Варфлусь - украинский просторечный вариант имени Варфоломей. Это имя произошло от арамейского сочетания Бар-Телеми, что означает «сын вспаханной земли», «сын полей». Покровителем этого имени является апостол Варфоломей. Дни его памяти приходятся на 24 июня, 13 июля и 7 сентября. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Варфлусь, со временем получил фамилию Варфлусев. О точном месте и времени возникновения фамилии Варфлусев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Варфлусев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.