Фамилия Варгулич — редкий пример, где необычный суффикс указывает на географию точнее, чем корень. Модель «-ич» в русских фамилиях чаще всего маркирует белорусское или польское происхождение (как у Мицкевича или Ковалевича), но в паре с основой «Варгул-» однозначной этимологии не даёт.

Корень «варг-» в славянских языках не встречается. Вероятнее всего, он восходит к литовскому или жемайтскому нарицательному слову: например, vargulis — «бедняк», «горемыка» (от vargas — «нужда», «горе»). В литовской антропонимии фамилии с основой Varg- (Варгус, Варгис) фиксируются с XVI века, а суффикс «-ич» мог добавиться уже на белорусско-литовском пограничье, где действовали смешанные словообразовательные модели. Таким образом, Варгулич могло означать «сын бедняка» или «потомок того, кто живёт в нужде».

Есть и другая, менее вероятная версия: от тюркского имени Варгул (встречается у крымских татар) с последующей славянизацией через суффикс «-ич». Но для неё нет подтверждений в массовых источниках — фамилия почти не встречается в южных регионах, зато спорадически попадается в Гродненской области и на юго-востоке Литвы, что поддерживает балтскую гипотезу.

Сословная принадлежность носителей не установлена: фамилия не попала в дворянские родословные книги Российской империи, а значит, предки, скорее всего, были крестьянами или мещанами. По той же причине в открытых источниках почти нет известных исторических фигур с фамилией Варгулич — это фамилия «тихой» периферии, где люди редко попадали в официальные хроники.

В современном русском языке фамилия склоняется по мужскому роду как существительное второго склонения (Варгулича, Варгуличу), а женский вариант остаётся неизменяемым. Ударение, судя по литовскому прототипу, падает на первый слог: Ва́ргулич.